CREARE IL LAYER PER IL PIANO D'ACQUA.

Creiamo il layer per il piano d'acqua.
Definiamo un materiale Matte/Shadows. Nelle impostazioni disabilita il parametro Opaque Alpha.

Apri la scena-base e assegna il materiale al piano d'acqua. Se renderizzi esso non compare, anche se la geometria è ancora presente.
Dal Virtual Frame Buffer attiviamo la visualizzazione del canale Alpha:

In questo modo possiamo essere sicuri di quali sono le zone opache (bianche) e quali trasparenti (nere), e immaginare quindi cosa accade se sovrapponiamo questa immagine a una già esistente (come ad esempio l'inmmagine di sfondo con la luna, vista qui sopra).
Salva l'immagine ottenuta in formato Targa, con questi parametri:

Quello che abbiamo ottenuto in realtà è un layer per gil edifici della scena, in cui il piano d'acqua non compare. Questo significa che potremo sovrapporre questo layer a un altro, che invece presenta soltanto il piano d'acqua visibile. Creiamolo subito.
Cancelliamo dalla scena tutti gli oggetti, tranne il piano d'acqua e le luci che ne influenzano l'illuminazione.

Al piano d'acqua assegna al posto del materiale Matte/Shadows il materiale acqua precedentemente creato. Inoltre disattiva dal pannello Environment la mappa di sfondo. Ecco come appare la scena:
Questo ottenuto, che presenta come elemento opaco solo il piano d'acqua, è il layer che andrà sotto quello che invece aveva gli edifici opachi e l'acqua trasparente.

Perchè allora nel primo layer semplicemente non è stato cancellato il piano d'acqua, al posto di assegnargli un materiale Matte/Shadows? Semplice: perchè altrimenti sarebbe apparsa anche la geometria degli edifici che si trova sotto il piano dell'acqua.
Invece con il materiale Matte/Shadows si sono mantenuti i contorni delle intersezioni fra gli edifici e il piano d'acqua.

Ecco il piano d'acqua animato:
(867K)

A questo punto non resta che renderizzare una serie di immagini Targa che verranno usate successivamente per sovrapporre questo layer animato agli altri.
Renderizza 100 fotogrammi sottoforma di immagini Targa in una directory apposta. Alla fine otterrai una serie di files numerati, ad esempio come questi:
Ne avrai uno per ogni fotogramma renderizzato (quindi alla fine ne avrai ad esempio da acqua0000.tga a  acqua0100.tga)
I file targa occupano abbastanza (circa 1.2M per immagini 640x480), ma è necessario conservarli almeno finchè tutti i layer animati non sono stati sovrapposti per formare il filmato finale.
Quindi renderizza questi file e conservali con cura.